Il Pastorale Nazionale della Comunità Gesù Ama è composto da sei membri: cinque laici e un sacerdote. I membri del pastorale vivono tra loro e con tutti i fratelli uno spirito di unità e di amore profondo, tutelando quella che è la profezia originaria fondamento della comunità stessa. Attualmente poi i membri del pastorale sono anche i fondatori della comunità, ma possono anche loro esser rinnovati qualora fosse necessario.

Il Pastorale Nazionale anima spiritualmente tutta la comunità, discerne l'autenticità della sua spiritualità, ne promuove l'incarnazione nella vita quotidiana, curandone e seguendone l'intero cammino e sollecitando tutti ad esprimersi secondo i propri carismi. Portando con sè il carisma di fondazione il pastorale nazionale è presente in ogni prima missione comunitaria per un annuncio profetico e per una evangelizzazione in linea con il contesto, in comunione con i sacerdoti, nel rispetto delle realtà già presenti. Visita periodicamente ogni comunità locale presente sul territorio nazionale, aiutandoli nella crescita spirituale, mettendone in luce i carismi, sostenendo la preghiera e contribuendo a far emergere in modo inequivocabile una realtà carismatica.

• Cura la crescita spirituale di tutti i membri del pastorale locale, dei responsabili, degli animatori, dell'equipe di missione, dei coordinatori dei giovani, delle comunità di servizio.
• Conferisce il mandato dell'imposizione mani e ha l'autorità di rimuovere in caso di gravi mancanze e qualora fosse realmente necessario, ogni fratello da qualsiasi tipo di responsabilità affidatagli.
• Intrattiene dialoghi e confronti frequenti con le autorità della Chiesa, vescovi, cardinali, sacerdoti che sostengono e alimentano la crescita delle comunità nell'ortodossia degli insegnamenti.
• Ascolta i bisogni dell'intera comunità in comunione con i responsabili ne propone le attività spirituali e ne cura la realizzazione.